來源:生物谷
諸如胚胎干細(xì)胞(ESC)和誘導(dǎo)性多能干細(xì)胞(iPS)之類的多能性干細(xì)胞是人體內(nèi)的一種特殊細(xì)胞,可以變成任何其他類型的細(xì)胞。多能性干細(xì)胞具有巨大的醫(yī)學(xué)潛力,目前利用多能性干細(xì)胞替代帕金森病等疾病中受損細(xì)胞的臨床試驗正在進(jìn)行中。
獲取多能性干細(xì)胞的一種方法是從人類胚胎中提取,但這存在倫理問題和實際限制。另一種方法是將皮膚或其他部位的成體細(xì)胞轉(zhuǎn)化為所謂的iPS細(xì)胞。然而,iPS細(xì)胞有時會攜帶它們曾經(jīng)是那種細(xì)胞的“記憶”,當(dāng)試圖將它們轉(zhuǎn)化為其他類型的細(xì)胞時,這可能會使它們變得不那么可預(yù)測或有效。在一項新的研究中,來自澳大利亞西澳大學(xué)、阿德萊德大學(xué)和莫納什大學(xué)(西湖大學(xué)劉曉東研究員為論文共同第一作者)等研究機(jī)構(gòu)的研究人員找到了消除這種記憶的方法,使iPS細(xì)胞的功能更像胚胎干細(xì)胞。相關(guān)研究結(jié)果于2023年8月16日在線發(fā)表在Nature期刊上,論文標(biāo)題為“Transient naive reprogramming corrects hiPS cells functionally and epigenetically”。
再生醫(yī)學(xué)的巨大前景
成熟、特化的細(xì)胞,如皮膚細(xì)胞,可以在實驗室中重編程為iPS細(xì)胞。iPS細(xì)胞在再生醫(yī)學(xué)領(lǐng)域大有可為。科學(xué)家們可以用患者自身的組織細(xì)胞制造 iPS 細(xì)胞,因此利用iPS 細(xì)胞產(chǎn)生的新細(xì)胞被患者免疫系統(tǒng)排斥的風(fēng)險較低。
使用 iPS 細(xì)胞的研究是一個快速發(fā)展的領(lǐng)域,但仍然存在許多技術(shù)挑戰(zhàn)??茖W(xué)家們?nèi)栽诿魅绾胃玫乜刂?iPS 細(xì)胞變成何種細(xì)胞類型,并確保這一過程是安全的。這些技術(shù)難題之一是“表觀遺傳記憶(epigenetic memory)”,即 iPS 細(xì)胞保留其曾經(jīng)細(xì)胞類型的痕跡。
表觀遺傳記憶及其如何影響 iPS 細(xì)胞的使用
人類的 DNA 攜帶著稱為基因的指令序列。當(dāng)多種因素在不改變 DNA 序列本身的情況下影響基因活動(開啟或關(guān)閉基因)時,這就是所謂的表觀遺傳學(xué)。細(xì)胞的表觀基因組是描述細(xì)胞中所有表觀遺傳修飾的統(tǒng)稱。人體中的每個細(xì)胞都含有相同的 DNA,但表觀基因組控制著哪些基因開啟或關(guān)閉,從而決定了它成為心臟細(xì)胞、腎臟細(xì)胞、肝細(xì)胞還是其他的細(xì)胞類型。
圖片來自Nature, 2023, doi:10.1038/s41586-023-06424-7
當(dāng)將成熟細(xì)胞重編程為 iPS 細(xì)胞時,人們希望清除它的所有表觀遺傳修飾。然而,這并不總能完全奏效。當(dāng)一些表觀遺傳修飾保留下來時,這種“表觀遺傳記憶”會影響 iPS 細(xì)胞的行為。
由皮膚細(xì)胞制成的 iPS 細(xì)胞會保留部分作為皮膚細(xì)胞的“記憶”,這使得它更有可能變回皮膚細(xì)胞,而較少可能變回其他類型的細(xì)胞。這是因為 DNA 的一些表觀遺傳標(biāo)記會告訴iPS細(xì)胞要表現(xiàn)得像皮膚細(xì)胞。
這可能是使用 iPS 細(xì)胞的一個障礙,因為它會影響把 iPS 細(xì)胞變成人們想要的細(xì)胞類型的過程。它還可能影響iPS細(xì)胞產(chǎn)生后的功能。如果想用 iPS 細(xì)胞幫助修復(fù)胰腺,但這些細(xì)胞有皮膚細(xì)胞的“記憶”,那么它們可能無法像真正的胰腺細(xì)胞那樣發(fā)揮良好的功能。
如何清除 iPS 細(xì)胞的表觀遺傳記憶并改善它們的功能
克服 iPS 細(xì)胞的表觀遺傳記憶問題是再生醫(yī)學(xué)面臨的一個公認(rèn)挑戰(zhàn)。通過研究將成體皮膚細(xì)胞重編程為 iPS 細(xì)胞時表觀基因組如何轉(zhuǎn)變,這些作者發(fā)現(xiàn)了一種新的細(xì)胞重編程方法,可以更徹底地清除表觀遺傳記憶。他們采用一種模擬胚胎細(xì)胞表觀基因組自然重置的方法對細(xì)胞進(jìn)行重編程,從而獲得了這一發(fā)現(xiàn)。
在胚胎植入子宮之前的早期發(fā)育過程中,從精子和卵細(xì)胞中遺傳下來的表觀遺傳標(biāo)記基本上會被清除。這種重置使早期胚胎細(xì)胞能夠重新開始,并在胚胎生長和發(fā)育過程中成為任何類型的細(xì)胞。
通過在這種重編程過程中引入一個步驟來短暫模擬這一重置過程,這些作者制造出了比傳統(tǒng)iPS細(xì)胞更像胚胎干細(xì)胞的iPS細(xì)胞。更有效地消除 iPS 細(xì)胞的表觀遺傳記憶將提高它們的醫(yī)療潛力。這將使 iPS 細(xì)胞表現(xiàn)得更像胚胎干細(xì)胞,使它們更有可能轉(zhuǎn)化為任何所需的細(xì)胞類型。
如果 iPS 細(xì)胞能忘記自己過去的身份,它們就能更可靠地變成任何類型的細(xì)胞,并幫助制造出治療所需的特定細(xì)胞,比如為糖尿病患者制造新的胰島素分泌細(xì)胞,或為帕金森病患者制造神經(jīng)元。當(dāng) iPS 細(xì)胞用于醫(yī)學(xué)治療時,這還可能降低出現(xiàn)意外行為或并發(fā)癥的風(fēng)險。
參考資料:
1. Sam Buckberry et al. Transient naive reprogramming corrects hiPS cells functionally and epigenetically. Nature, 2023, doi:10.1038/s41586-023-06424-7.
2. A 'memory wipe' for stem cells may be the key to better therapies. https://theconversation.com/a-memory-wipe-for-stem-cells-may-be-the-key-to-better-therapies-206230